１９５２年１０月、１２月，福建泉州市文化馆遴选本地著名提线木偶艺师相继组建性质为“民营公助”的“泉州木偶实验剧团”及“泉州木偶艺术剧团”。１９５６年３月，由泉州市政府（县级市）合并“实验”、“艺术”两团，成立地方国营“泉州木偶实验剧团”。１９６０年４月，合并“泉州布袋戏剧团”，扩建为“泉州木偶剧院”。１９７２年８月，改名为“泉州市木偶剧团”。

该团为泉州市（地级市）直属国办专业文艺表演团体。团址、剧场、文物陈列馆均设于泉州市通政巷２４号。该团创立５０年来，以传承古稀提线木偶艺术为主务。至今拥有《全本目连救母》等传统剧目七百余出和三百余支传统“傀儡调”曲牌及旋律曲调。且传承一整套表演“线规”及“压脚鼓”、“钲锣”、“嗳仔”、“拍板”等古稀乐器及其演奏方法。其偶像雕刻、粉彩等制作工艺，独特而精美，且葆有“唐风宋韵”，为世所珍。

剧团在继承、抢救古稀传统艺术的基础上，从木偶的头像造型、形象构造、线位布局、操弄技艺、舞台形式及演出剧目的题材、体裁、内容等方面，进行了全面的革新与创造，极大地丰富、提高了提线木偶戏的艺术表现力和演出水平。相继排演了大量整理改编传统剧、新编历史剧、神话剧、童话剧、现代剧、儿童剧、寓言剧，并先后十次参加由中央文化部举办的“艺术表演团体全国大巡回演出”，足迹几乎遍及祖国的大江南北、长城内外。

剧团所创作演出的剧目神话剧《水漫金山》、儿童剧《庆丰收》，赴罗马尼亚“第二届布加勒斯特国际木偶联欢节”获集体二等奖（一等奖缺）和银质奖章；神话剧《火焰山》、童话剧《千桃岩》晋京参加“庆祝建国三十周年献礼演出”，分别荣获演出一等奖、创作演出三等奖；童话剧《谗猫》晋京参加“全国木偶皮影观摩会演”，荣获文化部奖励；神话剧《太极图》参加“福建省第十七届戏剧展演”，荣获“木偶剧革新奖”，并应调赴京参加“第一届中国艺术节”；神话剧《劈山救母》，小品《驯猴》、《钟馗醉酒》、《狮子舞》晋京参加“全国木偶皮影戏汇演”，获优秀剧目奖、优秀表演奖等多项奖励。黄奕缺同志荣获文化部“特别荣誉奖”及福建省“百花文艺一等奖”；童话剧《小黑小金落难记》荣获“福建省第二十七届戏剧会演”演出奖等多项奖励；现代戏《赴宴斗鸠山》、歌舞剧《元宵乐》、童话剧《千桃岩》赴克罗地亚“第３２届国际木偶节”比赛，荣获最高奖——集体特别奖。２００２年创作演出《古艺新姿活傀儡》，荣获国家最高奖“第十届文华新剧目奖”，黄奕缺荣获木偶表演、木偶制作两个单项奖。该团还多次晋京参加全国会演、调演、献演活动及中央电视台“综艺大观”、“春节联欢晚会”等重大艺术活动。

自１９６０年以来，特别是改革开放以后，该团数十次应邀赴罗马尼亚、菲律宾、香港、日本、澳门、新加坡、荷兰、台湾、法国、瑞士、韩国、朝鲜、英国、伊拉克、也门、阿联酋、阿曼、马来西亚、西班牙、德国、美国、澳大利亚、克罗地亚、斯洛文尼亚、瑞典、丹麦、埃及、越南等国家和地区，进行访演及参加国际性文化交流活动，数十个国家及地区的上百家媒体对该团作过大量的专访和报道。所到之处，赞声不绝。

１９８６年、１９９９年、２０００年三届“中国泉州国际木偶节”的成功举办与２０００年“中国木偶与巴西面具”联合特种邮票的刊发，使泉州提线木偶戏与泉州市木偶剧团声誉日隆。泉州市木偶剧团作为海峡两岸传承古稀提线木偶艺术的代表性团体，已享有日益广泛而崇高的国际声誉。多年来在频繁的境外交流及境内涉外工作中，为对外、对台文化交流，作出了重要贡献。“八五”及“九五”期间，连续被中共福建省委评为“对外宣传先进单位”，并荣获文化部、国台办的通报表彰。该团现有团员５０名，分设传统艺术队、少儿艺术队、乐队、美术制作室、艺术创作室及办公室。拥有以国际著名提线木偶表演大师黄奕缺为代表的老、中、青三代艺术家及传统“八卦棚”式，首创之“天桥高台式”、“人偶同台式”等三种舞台演出形式和相应的演出剧目。剧目精良，技艺精湛，队伍精干。能适应国内外各种演出活动需要。

历任团（院长）为：张秀寅、吕赞成、王景贤。