纳西族是个信仰多种宗教的民族,既信仰本民族的本土宗教——东巴教,也信仰藏传佛教、汉传佛教和道教,各种宗教相容共存,和谐相处。
传统的东巴教历史悠久,是一种融汇了多种文化因素而独具特色的民族宗教形态。泛灵信仰、大自然崇拜、祖先崇拜、探索人与自然的和谐关系等是东巴教的主要特征。
藏传佛教是从元末开始,由西藏经川西传入纳西族地区的,得到明代纳西木氏土司的大力扶持,土司木增曾在丽江主持刊印《大藏经》108卷,成为滇藏文化史上的盛事。藏传佛教噶玛噶举派(白教)在丽江、维西纳西族地区得以繁荣,形成著名的“滇西北13大寺”。宁蒗县永宁地区自称“纳日”的纳西族的藏传佛教信仰则以格鲁(黄教)派为主。
汉传佛教在明初传入丽江纳两族地区。木氏土司在明代盖了庞大的汉传佛教寺庙群,20世纪50年代前,几乎在每个较大的村子都有一个寺庙。
道教最迟在明代中叶传到丽江。木氏土司于明代在丽江修建了数十个道观。现在,随着时代和文化变迁,上述诸种宗教在丽江纳西族地区业已衰落。