辛亥革命后，1912年3月新疆巡抚袁大化遵旨承认共和，从此新疆进入民国时期。1919年，阿勒泰地区改归新疆省长管理。1944年9月以前，杨增新、金树仁、盛世才相继在新疆实行封建割据式的独裁统治，他们使新疆处于封闭的状态，与中原的联系被人为地切断。这期间，新疆制度多变，局势动荡。1933年8月，英国、印度政府派出间谍利用印度商人在南疆的广泛联系，收买许多当地人充当英国间谍和宣传员，鼓吹“大土耳其主义”和“大伊斯兰主义”。1933年11月12日，在英国驻喀什领事的精心策划并给予1000支来福枪和200名士兵的支持下，“东土耳其斯坦伊斯兰共和国”在喀什宣告出笼，并提出“保护宗教，杀汉灭回”的口号，推行极端的宗教主义和民族主义，对回、汉等民族人民采取斩尽杀绝的政策。1934年2月6日，马仲英所部军队开进喀什，“东土耳其斯坦伊斯兰共和国”不堪一击，土崩瓦解。

1944年9月，在伊犁、塔城、阿山（今阿勒泰）三个地区以及其他一些地区，爆发了一场由多民族群众参加的起义。民族军打到了玛纳斯河西，与国民党军队对峙，时称“三区革命”。

（据:郝文明、王铁志主编之国家民委民族问题研究中心专著《中国民族》，中央民族大学出版社，2001年3月版。）